农业部微生物肥料和食用菌菌种质量监督检验测试中心，农业部微生物产品质量安全风险评估实验室（北京）、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所起草，于2015年8月发布的复合微生物肥料标准对复合微生物肥料的技术指标和无害化指标分别做了如下要求，对此种类型的肥料生产做出了指导。
复合微生物肥料的技术指标
复合微生物肥料的无害化指标
